librairy.io
Se faire accompagner

Les meilleurs logiciels de facturation pour auto-entrepreneur

5 outils sélectionnés et testés

En micro-entreprise, le besoin ne s'arrête pas à éditer une facture : il faut suivre son chiffre d'affaires pour ne pas dépasser les seuils, déclarer à l'URSSAF, et rester conforme à la facturation électronique. Les outils de cette page couvrent ces trois points à des degrés très différents.

Prix relevés sur les pages officielles des éditeurs le 1er août 2026, hors promotions temporaires.

Notre recommandation rapide

1Le mieux noté
IndyComptabilité & finance

La comptabilité gratuite et automatisée pour les indépendants et freelances français

Voir la fiche →
2Excellent choix
TiimeComptabilité & finance

L'application mobile-first de gestion et pré-comptabilité avec compte pro intégré pour les TPE françaises

Voir la fiche →
3À découvrir
ShineComptabilité & finance

Le compte pro et l'assistant administratif pour freelances et indépendants, avec facturation intégrée

Voir la fiche →

Tous les résultats

5 outils
OutilIdéal pourPrixFRNiveauVerdictNote
IndyLa comptabilité gratuite et automatisée pour les indépendants et freelances françaisFreemiumOuiDébutantTrès bon★ 4.4
TiimeL'application mobile-first de gestion et pré-comptabilité avec compte pro intégré pour les TPE françaisesFreemiumOuiDébutantBon choix★ 4.2
ShineLe compte pro et l'assistant administratif pour freelances et indépendants, avec facturation intégréeFreemiumOuiDébutantTrès bon★ 4.3
DougsL'expert-comptable en ligne qui allie vrai suivi humain et automatisation comptable pour les dirigeantsPayantOuiDébutantTrès bon★ 4.6
PennylaneLa plateforme comptable et financière tout-en-un pensée pour les PME françaises et leurs experts-comptablesFreemiumOuiDébutantTrès bon★ 4.5

Questions fréquentes

Quel logiciel de facturation choisir en auto-entrepreneur ?

Si vous voulez le coût le plus bas, Indy et Tiime ont tous deux une offre gratuite qui suffit pour facturer. Si vous voulez déléguer la comptabilité, Dougs et Pennylane vont plus loin. Shine a l'avantage d'inclure un compte bancaire professionnel dans le même abonnement.

Faut-il un logiciel payant quand on est auto-entrepreneur ?

Pas nécessairement pour facturer : plusieurs offres gratuites permettent des devis et factures illimités conformes. Le payant devient utile quand vous voulez automatiser les relances d'impayés ou faire télétransmettre vos déclarations fiscales, à partir d'environ 9 € HT par mois.

Ces logiciels gèrent-ils la déclaration URSSAF ?

Indy est le plus avancé sur ce point avec des déclarations automatisées et télétransmises sur son plan Premium, dont le tarif varie selon le statut juridique. Vérifiez toujours que votre statut précis est couvert avant de souscrire.

Quand un auto-entrepreneur doit-il passer à la facture électronique ?

Le calendrier officiel est le suivant : depuis le 1er septembre 2026, toutes les entreprises, quelle que soit leur taille, doivent être en mesure de recevoir des factures électroniques ; au 1er septembre 2027, les petites et micro-entreprises devront aussi les émettre et transmettre leurs données de e-reporting (source : economie.gouv.fr). En micro-entreprise, recevoir est donc déjà obligatoire, émettre le sera en septembre 2027.

Besoin d’aide pour choisir et installer le bon outil ?

On intègre l’IA adaptée à votre métier, sans jargon, dans votre entreprise.

Parler à un expert →